AlphaFold - 단백질 접힘 문제의 솔루션
(deepmind.com)- DeepMind에서 개발한 단백질 접힘 문제를 해결하는 신경망 모델
## 단백질 접힘 문제
- 단백질은 아미노산이 사슬 형태로 연결되어 입체적으로 접힌 복잡한 구조
- 단백질을 구성하는 아미노산과 접혀있는 구조에 따라 여러가지 기능을 함
- 그러나 아미노산의 배열만 가지고 단백질의 구조를 예측하는 것은 매우 어려움
## AlphaFold
- 단백질 데이터 뱅크의 약 170,000개 단백질 구조 데이터와 그 밖에 구조가 알려지지 않은 단백질 데이터를 학습
- 약 128개의 TPUv3 코어를 사용해 몇 주간 학습
## CASP(Critical Assessment of protein Structure Prediction)
- 1994년에 최초로 개최된 2년마다 열리는 세계 단백질 구조 예측 대회
- 아직 구조가 알려지지 않은 단백질의 구조를 예측
- AlphaFold의 초기버전이 2018년에 열린 CASP13에 참가
- 2020년에 열린 CASP14에서 AlphaFold가 평균 92.4 GDT로 1위
- 이는 원자 1개의 너비 정도의 오차
## 기대효과 및 전망
- 올해 AlphaFold는 ORF3a, ORF8 등 코로나 바이러스 단백질을 예측함
- 앞으로 여러 생물학적 문제 해결과 신약 개발 등에 기여할 것이 기대됨
세포 노화를 되돌리는데 단백질을 사용한다는 기사가 나왔던데
인공지능이 생명연장의 꿈을 이루는데 큰일을 할지도 모르겠네요.
노화한 피부세포 다시 젊게 만드는 '세포 역노화' 기술 나왔다
http://m.dongascience.donga.com/news.php?idx=41855
세포 노화를 되돌리는 전략으로 ‘역분화’ 기술이 가장 널리 연구되고 있다. 역분화는 피부세포처럼 특정신체 조직으로 자란 세포에 ‘야마나카 전사인자’라는 단백질 4종을 추가해 특정세포로 분화하기 이전의 젊은 상태로 되돌리는 기술이다