1P by neo 1달전 | favorite | 댓글 1개

Chai-1 소개: 생명 분자의 상호작용 해독

  • Chai-1 출시
    • Chai-1은 약물 발견에 관련된 다양한 작업에서 최첨단 성능을 발휘하는 새로운 다중 모드 기반 모델임
    • 단백질, 소분자, DNA, RNA, 공유 결합 수정 등을 통합 예측 가능
    • 웹 인터페이스를 통해 무료로 제공되며, 상업적 용도로도 사용 가능
    • 비상업적 용도로는 모델 가중치와 추론 코드를 소프트웨어 라이브러리로 제공

생체 분자 상호작용을 위한 최첨단 모델

  • 성능 평가
    • PoseBusters 벤치마크에서 77% 성공률 달성 (AlphaFold3는 76%)
    • CASP15 단백질 단량체 구조 예측 세트에서 Cα LDDT 0.849 달성 (ESM3-98B는 0.801)
    • 다중 서열 정렬(MSA)을 필요로 하지 않으며, 단일 서열 모드에서도 높은 성능 유지
    • 다중체 구조 예측에서 AlphaFold-Multimer 모델보다 더 정확한 예측률 (69.8% vs. 67.7%)
    • 단일 서열만으로 AlphaFold-Multimer 수준의 품질로 다중체 구조 예측 가능

네이티브 다중 모드 기반 모델

  • 추가 데이터 활용
    • 실험실에서 유래한 제한 조건 등 새로운 데이터로 성능 향상 가능
    • 항체-항원 구조 예측 정확도를 두 배로 높이는 에피토프 조건화 등 다양한 기능 탐구

모델 공개

  • 무료 웹 인터페이스 제공
    • 상업적 용도로도 사용 가능
    • 비상업적 용도로는 소프트웨어 라이브러리로 코드 공개
    • 연구 및 산업 커뮤니티와의 협력을 통해 생태계 전체에 이익 제공

다음 단계

  • 팀 배경
    • OpenAI, Meta FAIR, Stripe, Google X 등 선도적인 연구 및 응용 AI 회사 출신
    • AI를 활용한 생물학 연구의 발전에 중요한 역할 수행
    • Chai-1은 몇 달간의 집중 작업의 결과이며, 이제 시작 단계
    • 생물학을 과학에서 공학으로 변환하는 것이 목표
    • 생화학 분자 간의 상호작용을 예측하고 재프로그래밍하는 AI 기반 모델 추가 개발 예정

GN⁺의 정리

  • Chai-1은 약물 발견과 생명 과학 연구에 중요한 도구로, 단백질, 소분자, DNA, RNA 등의 구조 예측에서 최첨단 성능을 발휘함
  • 다중 서열 정렬 없이도 높은 성능을 유지하며, 다중체 구조 예측에서도 우수한 성능을 보임
  • 연구 및 산업 커뮤니티와의 협력을 통해 생태계 전체에 이익을 제공하며, 무료로 사용할 수 있는 웹 인터페이스와 비상업적 용도의 소프트웨어 라이브러리를 제공함
  • 생물학을 공학으로 변환하는 것을 목표로, 생화학 분자 간의 상호작용을 예측하고 재프로그래밍하는 AI 모델을 추가로 개발할 예정임
Hacker News 의견
  • Reflection 사건 이후 독립적인 테스트에 대한 열정이 생겼음
  • SOTA 평가를 그대로 받아들이지 않기를 바람
  • Chaipytorch3d에서 쿼터니언 함수를 복사해 사용한 것을 발견함
  • 단백질 구조 지식이 약물 개발의 제한 요소가 아님
    • 결과가 약물 개발 파이프라인에 미치는 영향을 추정하는 것이 흥미로움
  • **"foundation"**과 "multi-modal" 용어가 논문 초록에만 등장함
    • AlphaFold 방법을 복사하고 언어 임베딩과 기타 제약 조건을 추가함
    • 성능 향상 데이터가 부족함
  • 오차 범위가 매우 큼
  • 공개 위험성이 있음
    • 새로운 생물 무기 개발에 악용될 수 있음
  • 바이오해커가 새로운 단백질을 개발하는 것이 얼마나 어려운지 궁금함
  • HN 제목이 부정확함
    • 1% 높은 점수가 이전 모델을 이긴 것은 아님
  • 베팅 라인이 있다면 조기 은퇴 가능함
  • AutoDock Vina의 저자임
    • 도킹 소프트웨어는 새로운 결합체를 찾기 위해 일반화가 필요함
    • 평가 접근 방식이 새로운 분자에 대한 성능을 테스트하지 않음
    • Chai-1의 출시가 방법 평가에 도움이 될 것임