그와 그의 배에서 함께 경주한 적이 있음. 한 번은 자이브 중에 그가 바다로 쓸려 나갔고, 메인시트가 몸통을 감았음
물속으로 끌려가면서도 어떻게든 난간을 붙잡고 있었고, 내가 방수복의 고리 부분을 잡아 다시 배 위로 끌어올릴 수 있었음
그는 흥미로운 사람이었고, 베트남전 때 의무병으로 복무했으며, 예전 배 Sorcerer II는 2003~2010년 Global Ocean Sampling Expedition의 플랫폼이 되어 수백만 개의 새로운 해양 미생물 유전자를 발견했음
친구도 많이 만들었고 적도 꽤 있었지만, 자기만의 이상하고도 놀라운 방식으로 지구에서 온전한 인간의 삶을 산 것처럼 보임
겨우 79세라니, 온전한 인간 경험이라고 하기엔 너무 짧음. 특히 가장 뛰어난 사람들일수록 이곳에서 주어진 시간이 너무 적다는 게 몹시 슬프다
어릴 때 60 Minutes에서 그의 인터뷰를 봤음. 올림픽 수영 선수의 꿈을 접고 대학을 중퇴했고, 이후 베트남에서 의무병으로 복무했으며, 해군 함정에서 뛰어내려 자살을 시도했지만 거의 올림픽급 운동선수였던 덕분에 살아남았다고 했음
나중에 Cornell University에서 그의 오랜 친구인 유전학자 Andy Clark와 함께 인간 유전체에 대해 강연하는 모습을 실제로 봤는데, 키도 크고 존재감이 압도적이었고 대머리였음
몇 년 뒤 San Diego로 이사해 서핑을 시작했는데, 서핑 웹사이트를 보다가 갑자기 Craig Venter가 고급 시계 광고에 등장했음. 바다에서 요트 타며 당시 내 대학원 생활비보다 비쌌을 법한 Jaeger-LeCoultre 시계를 차고 있었음
그 뒤 몇 년 후 그의 회사 중 하나인 Synthetic Genomics에서 면접을 봤고, 생물정보학 팀은 회사가 방향 전환을 너무 많이 해서 정신없어 보였음. 바이오연료 생산에서 인간에게 이식 가능한 신장을 만들도록 돼지를 유전공학적으로 조작하는 일로 옮겨갔는데, 몇 년 안에 실제로 그 아이디어가 작동하기 시작했음
결국 Venter와 그의 업적은 내 성인 커리어 전체, 즉 생물학·유전학·생물정보학·기계학습의 배경처럼 깔려 있었음. 위대한 과학을 현실로 만들려면 때로는 압도적인 성격의 인물이 필요함
좋은 이야기들임. 그가 바이오연료에서 방향을 튼 뒤 돼지 관련 일을 물어본 적이 있음. 아마 Exxon에서 1억 5천만 달러를 조달했던 것 같음
기억이 맞다면 그는 SeriusXM와 United Therapeutics를 만든 악명 높은 창업자 Martin, 지금은 Martine Rothblatt와 협업했음
Craig Venter는 Human Genome Project에 관여한 것으로 유명함. Clinton 대통령과 Francis Collins와 함께 인간 유전체의 첫 초안을 발표했음
“관여”라는 건 공공 데이터를 가져다가 자신들이 사적으로 만든 소량의 데이터를 더해 첫 조립을 얻으려 했다는 의미에 가까움
Human Genome Project의 과학자들은 그가 전체를 특허로 묶어 다른 사람들이 돈을 내게 만들려 한다고 생각했음. 당시에는 무엇이 특허 가능하고 불가능한지 명확하지 않았음
그래서 그의 관여는 공공 프로젝트가 유전체 조립 경쟁에 뛰어들도록 자극한 데 있었고, 이는 공공 쪽에서 완전히 계획해 두지 않았던 거대한 계산 문제였음 https://archive.is/2022.02.14-091753/https://www.nytimes.com...
그가 곧 Human Genome Project였다고도 볼 수 있음. 샘플 중 하나가 자기 자신이 되도록 했던 것으로 알고 있음
그는 매우 조심스러운 과학자들이 지배하던 분야에서, 좋은 의미로 꽤 충격적인 기업가이자 발명가였음
물론 그 과학자들도 훌륭했지만, 그가 해낸 시점에서 10~20년 안에 유전체를 해독했을 가능성은 낮아 보임. 문화적으로는 1980년대 NASA에 가까운 분야에서 Apollo Project를 벌인 셈이었음
내가 이해하기로는 Hamilton Smith가 산탄 염기서열 분석(shotgun sequencing)이 작동할 거라고 밀어붙였음
NIH 쪽은 Celera가 유전체를 너무 빠르게 조립하기 전까지 프라이머 워킹을 고집했고, 이후 NIH도 산탄 방식에 합류해야 했음
생물학 학부를 했고, 교수 중 한 명이 이 일에 참여했음. 그 교수는 Human Genome Project가 Celera보다 먼저 끝났고, Venter 팀의 산탄 접근이 작동하려면 근본적으로 HGP가 공개한 참조 데이터에 의존해야 했다고 강하게 말했음
Craig Venter의 명복을 빎
초등학교 5학년 때 Human Genome Project 이야기를 들었던 기억이 있음. 당시엔 급진적인 시도로 소개됐음
30년이 지난 지금 얼마나 멀리 왔는지 보라. 며칠 전 UK Biobank 유출(https://news.ycombinator.com/item?id=47875843)에 대해 읽었는데, 상당한 수의 완전한 인간 유전체가 유출되고 있다는 내용이 있었음. 예전에는 사람들이 Craig Venter를 정말 대단히 앞서간 사람으로 봤다는 생각이 들었음
안타까운 소식임. 아마 10년 전쯤 학회에서 Craig를 아주 잠깐 만났음
당시 나는 유전학을 거의 독학으로 공부하던 수준이라 Craig와 같은 급은 아니었지만, 그는 매우 적극적으로 대화에 임했고 사려 깊게 이야기할 시간을 내줬음
세계적, 어쩌면 우주적 수준의 자기중심적 인물이었고, 첫 이배체 인간 유전체 서열을 발표했음. 그건 자기 자신의 DNA였음
그는 업적을 인간 청중에게 알리는 데서 멈추지 않았음. “내 유전체가 해독된 이후, 내 소프트웨어는 전자기파 형태로 우주에 송출되어 내 유전 정보를 지구 너머 멀리까지 운반했다”고 했음
전체 유전체 서열을 발표했을 당시 나는 분자생물학 인턴이었음. 실험실에 열순환기가 있었고, 종이 일정표에 사용 시간을 예약해야 했음
여러 랙마다 열순환기가 빽빽이 들어찬 모습 앞에 선 그의 사진이 기억남. 그는 규모에 대해 한 가지를 가르쳐줬고, 때로는 지금 가진 것을 보고 “이걸 200배로 늘리면 어떨까”라고 묻는 게 가치 있음을 증명했음
소프트웨어에서는 GPU 배열 같은 걸 생각하면 당연해 보일 수 있지만, 습식 실험실과 장비 종이 예약표에 익숙한 사람이라면 이야기가 다름. 생명과학에서도 가끔은 무식한 규모 확장을 쓸 수 있다면 더 많은 돌파구가 나올 수 있지 않을까 싶음
나는 통계학자이고 아내는 기초 생물과학을 함. 아내가 실험에 대해 조언을 구할 때마다 거의 매번 표본 크기를 10배로 늘리라고 말하고 싶어짐
하지만 학계에는 표본 크기가 어느 정도여야 하는지에 대한 고정관념이 있고, 급진적으로 더 큰 표본을 쓰려 하면 동물실험의 윤리 문제부터 연구비까지 온갖 장벽에 부딪힘
결국 표본 크기 12로 배울 수 있는 것에는 한계가 있음. 아무것도 배우지 못하는 12마리짜리 쥐 실험을 여러 번 낭비하는 것이, 100마리를 써서 가장 거대한 효과 크기 말고도 실제로 식별할 통계적 검정력을 얻는 것보다 더 윤리적인지는 모르겠음
나는 실험실 자동화 일을 하는데, 종이 일정표에서 정말 멀리 오긴 했음. 물론 그런 일정표도 아직 꽤 많이 쓰임 :)
Hacker News 의견들
그와 그의 배에서 함께 경주한 적이 있음. 한 번은 자이브 중에 그가 바다로 쓸려 나갔고, 메인시트가 몸통을 감았음
물속으로 끌려가면서도 어떻게든 난간을 붙잡고 있었고, 내가 방수복의 고리 부분을 잡아 다시 배 위로 끌어올릴 수 있었음
그는 흥미로운 사람이었고, 베트남전 때 의무병으로 복무했으며, 예전 배 Sorcerer II는 2003~2010년 Global Ocean Sampling Expedition의 플랫폼이 되어 수백만 개의 새로운 해양 미생물 유전자를 발견했음
친구도 많이 만들었고 적도 꽤 있었지만, 자기만의 이상하고도 놀라운 방식으로 지구에서 온전한 인간의 삶을 산 것처럼 보임
어릴 때 60 Minutes에서 그의 인터뷰를 봤음. 올림픽 수영 선수의 꿈을 접고 대학을 중퇴했고, 이후 베트남에서 의무병으로 복무했으며, 해군 함정에서 뛰어내려 자살을 시도했지만 거의 올림픽급 운동선수였던 덕분에 살아남았다고 했음
나중에 Cornell University에서 그의 오랜 친구인 유전학자 Andy Clark와 함께 인간 유전체에 대해 강연하는 모습을 실제로 봤는데, 키도 크고 존재감이 압도적이었고 대머리였음
몇 년 뒤 San Diego로 이사해 서핑을 시작했는데, 서핑 웹사이트를 보다가 갑자기 Craig Venter가 고급 시계 광고에 등장했음. 바다에서 요트 타며 당시 내 대학원 생활비보다 비쌌을 법한 Jaeger-LeCoultre 시계를 차고 있었음
그 뒤 몇 년 후 그의 회사 중 하나인 Synthetic Genomics에서 면접을 봤고, 생물정보학 팀은 회사가 방향 전환을 너무 많이 해서 정신없어 보였음. 바이오연료 생산에서 인간에게 이식 가능한 신장을 만들도록 돼지를 유전공학적으로 조작하는 일로 옮겨갔는데, 몇 년 안에 실제로 그 아이디어가 작동하기 시작했음
결국 Venter와 그의 업적은 내 성인 커리어 전체, 즉 생물학·유전학·생물정보학·기계학습의 배경처럼 깔려 있었음. 위대한 과학을 현실로 만들려면 때로는 압도적인 성격의 인물이 필요함
기억이 맞다면 그는 SeriusXM와 United Therapeutics를 만든 악명 높은 창업자 Martin, 지금은 Martine Rothblatt와 협업했음
아이러니하게도 그는 생애 마지막 몇 년을 수명 연장에 쓰고 있었고[1], 감당할 수 있는 사람들에게 25,000달러짜리 “선제적 의료 서비스” 상담을 팔고 있었음[2]
1: 회사 웹사이트 humanlongevity dot com은 침해된 것처럼 보이고, “captcha”라며 트로이목마 설치를 유도함. 그래서 대신 Wikipedia 페이지를 둠: https://en.wikipedia.org/wiki/Human_Longevity
2: https://fortune.com/2017/02/21/craig-venter-human-longevity/
Craig Venter는 Human Genome Project에 관여한 것으로 유명함. Clinton 대통령과 Francis Collins와 함께 인간 유전체의 첫 초안을 발표했음
Human Genome Project의 과학자들은 그가 전체를 특허로 묶어 다른 사람들이 돈을 내게 만들려 한다고 생각했음. 당시에는 무엇이 특허 가능하고 불가능한지 명확하지 않았음
그래서 그의 관여는 공공 프로젝트가 유전체 조립 경쟁에 뛰어들도록 자극한 데 있었고, 이는 공공 쪽에서 완전히 계획해 두지 않았던 거대한 계산 문제였음
https://archive.is/2022.02.14-091753/https://www.nytimes.com...
그는 매우 조심스러운 과학자들이 지배하던 분야에서, 좋은 의미로 꽤 충격적인 기업가이자 발명가였음
물론 그 과학자들도 훌륭했지만, 그가 해낸 시점에서 10~20년 안에 유전체를 해독했을 가능성은 낮아 보임. 문화적으로는 1980년대 NASA에 가까운 분야에서 Apollo Project를 벌인 셈이었음
NIH 쪽은 Celera가 유전체를 너무 빠르게 조립하기 전까지 프라이머 워킹을 고집했고, 이후 NIH도 산탄 방식에 합류해야 했음
Craig Venter의 명복을 빎
초등학교 5학년 때 Human Genome Project 이야기를 들었던 기억이 있음. 당시엔 급진적인 시도로 소개됐음
30년이 지난 지금 얼마나 멀리 왔는지 보라. 며칠 전 UK Biobank 유출(https://news.ycombinator.com/item?id=47875843)에 대해 읽었는데, 상당한 수의 완전한 인간 유전체가 유출되고 있다는 내용이 있었음. 예전에는 사람들이 Craig Venter를 정말 대단히 앞서간 사람으로 봤다는 생각이 들었음
안타까운 소식임. 아마 10년 전쯤 학회에서 Craig를 아주 잠깐 만났음
당시 나는 유전학을 거의 독학으로 공부하던 수준이라 Craig와 같은 급은 아니었지만, 그는 매우 적극적으로 대화에 임했고 사려 깊게 이야기할 시간을 내줬음
세계적, 어쩌면 우주적 수준의 자기중심적 인물이었고, 첫 이배체 인간 유전체 서열을 발표했음. 그건 자기 자신의 DNA였음
그는 업적을 인간 청중에게 알리는 데서 멈추지 않았음. “내 유전체가 해독된 이후, 내 소프트웨어는 전자기파 형태로 우주에 송출되어 내 유전 정보를 지구 너머 멀리까지 운반했다”고 했음
그가 남긴 흥미로운 발언이 있음
“
SPIEGEL: 그렇다면 Collins를 진정한 과학자로 보지 않는다는 건가요?
Venter: 그냥 정부 행정가라고 해두죠
”
https://www.science.org/content/blog-post/craig-venter-venti...
전체 유전체 서열을 발표했을 당시 나는 분자생물학 인턴이었음. 실험실에 열순환기가 있었고, 종이 일정표에 사용 시간을 예약해야 했음
여러 랙마다 열순환기가 빽빽이 들어찬 모습 앞에 선 그의 사진이 기억남. 그는 규모에 대해 한 가지를 가르쳐줬고, 때로는 지금 가진 것을 보고 “이걸 200배로 늘리면 어떨까”라고 묻는 게 가치 있음을 증명했음
소프트웨어에서는 GPU 배열 같은 걸 생각하면 당연해 보일 수 있지만, 습식 실험실과 장비 종이 예약표에 익숙한 사람이라면 이야기가 다름. 생명과학에서도 가끔은 무식한 규모 확장을 쓸 수 있다면 더 많은 돌파구가 나올 수 있지 않을까 싶음
하지만 학계에는 표본 크기가 어느 정도여야 하는지에 대한 고정관념이 있고, 급진적으로 더 큰 표본을 쓰려 하면 동물실험의 윤리 문제부터 연구비까지 온갖 장벽에 부딪힘
결국 표본 크기 12로 배울 수 있는 것에는 한계가 있음. 아무것도 배우지 못하는 12마리짜리 쥐 실험을 여러 번 낭비하는 것이, 100마리를 써서 가장 거대한 효과 크기 말고도 실제로 식별할 통계적 검정력을 얻는 것보다 더 윤리적인지는 모르겠음