알림을 못봐서 뒤늦게 확인하고 답변드립니다.

질문 1.
header, footer 가 보이지 않는 것은 화면이 잘려서 그런 것 같은데,
실제 window 사이즈에 맞게 나오도록 수정하도록 하겠습니다.

그리고 현재 슬라이드쇼에서 특정 슬라이드로 가도록 하는 기능은 제공되지 않습니다ㅠ
Marp에서 제공하는 아래 기능에 대해서 우선순위를 조금 높여서 구현할 수 있도록 하겠습니다.
https://github.com/orgs/marp-team/…

질문 2.
header, footer, paginate 정보도 함께 노출된다는 것이 어떤 의미인지 잘 이해하지 못했습니다.
현재 .md 파일로 저장을 하게 되면 저장하는 시점의 Slide setting이 marp 호환 형태로 함께 들어가긴 합니다.
이 부분은 조금 더 설명을 해주시면 좋을 것 같습니다!